Геном Джонатана указал на возможный след его долголетия

Самец альдабрской черепахи Джонатан живет на острове Святой Елены с XIX века. Если ему действительно около 194 лет, он старейшее из известных ныне живущих наземных животных. Сухопутные черепахи нередко живут больше 100 лет, а отдельные особи дольше 150.

Джонатан заметно превзошел эти цифры. У гигантских черепах уже находили особенности последовательности ДНК. Не было ясно, добавляется ли к ним эпигенетика: клетки включают и выключают гены, не меняя сам текст ДНК.

С годами метильных меток в одних местах становится больше, в других меньше. Стивен Кларк и коллеги из фонда Kallel сопоставили геном с возрастными метками. Кровь брать не разрешили, образцы взяли изо рта и слюны.

Прочитали около 1,1 миллиарда коротких фрагментов, сверили их с эталоном 36-летнего Танка и нашли примерно 6,9 миллиона вариантов, часть которых отличала Джонатана, в том числе от Одинокого Джорджа. Метилирование смотрели у Джонатана, пятилетнего Хэтча, 12-летнего Смоллса, Токи и Поки. В 287 генах нашлись уникальные замены, способные изменить белки, в том числе в генах починки ДНК, теломер, обмена веществ и митохондрий.

На участках, связанных с выработкой энергии, рисунок меток у Джонатана оставался таким же собранным, как у пятилетней черепахи. Авторы допускают связь с энергией для починки ДНК, но не доказали, что именно она объясняет почти два столетия жизни. Работа вышла в Science Advances.